Scanpy80
Single-cell analysis in Python. Scales to >100M cells.
2.5K
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Catégorie: geo-scienceAudit
Annuaire de skills
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Résultats de recherche: scverse
Annuaire en anglaisanndata77
Data structure for annotated matrices in single-cell analysis. Use when working with .h5ad files or integrating with the scverse ecosystem. This is the data format skill—for analysis workflows use scanpy; for probabilistic models use scvi-tools; for population-scale queries use cellxgene-census.
34K
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Catégorie: data-analysisAudit
Anndata71
Annotated data.
752
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Catégorie: geo-scienceAudit
PyDESeq271
A Python implementation of the DESeq2 pipeline for bulk RNA-seq DEA.
753
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Catégorie: geo-scienceAudit
Squidpy71
Spatial Single Cell Analysis in Python
578
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Catégorie: data-analysisAudit
Cellrank69
CellRank: dynamics from multi-view single-cell data
453
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Catégorie: geo-scienceAudit
rapids-singlecell: GPU-accelerated framework for scRNA analysis
377
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68/100
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Catégorie: geo-scienceAudit