Scanpy80
Single-cell analysis in Python. Scales to >100M cells.
2.5K
Stars
80/100
Trust
Kategorie: geo-scienceAudit
Skill-Verzeichnis
Wiederverwendbare Skills für AI Agents entdecken.
Durchsuche reale GitHub-Skills nach Aufgabe und prüfe Stars, Trust, Audit, Kategorie und Installationspfad vor der Verwendung.
Jede Empfehlung bleibt mit ihrem Repository, Audit und Installationspfad nachvollziehbar.
Suchergebnisse: scverse
Englisches Verzeichnisanndata77
Data structure for annotated matrices in single-cell analysis. Use when working with .h5ad files or integrating with the scverse ecosystem. This is the data format skill—for analysis workflows use scanpy; for probabilistic models use scvi-tools; for population-scale queries use cellxgene-census.
34K
Stars
77/100
Trust
Kategorie: data-analysisAudit
Anndata71
Annotated data.
752
Stars
71/100
Trust
Kategorie: geo-scienceAudit
PyDESeq271
A Python implementation of the DESeq2 pipeline for bulk RNA-seq DEA.
753
Stars
71/100
Trust
Kategorie: geo-scienceAudit
Squidpy71
Spatial Single Cell Analysis in Python
578
Stars
71/100
Trust
Kategorie: data-analysisAudit
Cellrank69
CellRank: dynamics from multi-view single-cell data
453
Stars
69/100
Trust
Kategorie: geo-scienceAudit
rapids-singlecell: GPU-accelerated framework for scRNA analysis
377
Stars
68/100
Trust
Kategorie: geo-scienceAudit