Pysam
Pysam is a Python package for reading, manipulating, and writing genomics data such as SAM/BAM/CRAM and VCF/BCF files. It's a lightweight wrapper of the HTSlib API, the same one that powers samtools, bcftools, and tabix.
Asset-Profil
Coding- und Entwickler-Agents
Code review, repo analysis, testing, CI, GitHub, DevOps, and developer workflow skills.
Szenario
GitHub automation
I need my agent to triage GitHub issues, review pull requests, and summarize repository changes.
Agent-Fit
Claude Code + CLI + Codex
Geeignet für Codex, Claude Code, Cursor, CLI oder benutzerdefinierte Agents.
Installieren
Bereit
npx skills add pysam-developers/pysam
Wartung
Aktiv
3 Monate seit dem letzten Push
Risiko
Prüfung nötig
Financial research output is not financial advice; require human review before any live investment decision
GitHub-Qualität
895
81/100 Qualität · 81/100 Vertrauen
Abdeckungs-Tags
Review-Notizen
Financial research output is not financial advice; require human review before any live investment decision · Financial research output is not financial advice; require human review before any live investment decision.
Agent-Adoptionskarte
Vertrauen, Audit und Installationsbereitschaft auf einen Blick
Diese Werte kombinieren öffentliche Repository-Metadaten, OpenAgentSkill-Reviewsignale, Wartungsaktualität und Installationsbereitschaft. Sie helfen bei der Vorauswahl, ersetzen aber keine menschliche Prüfung.
Qualität
StarkSolid option that is likely worth shortlisting for production workflows.
Vertrauen
Nur SandboxNützlicher Kandidat mit fehlenden oder gemischten Vertrauenssignalen. Bis der Ergebniszyklus die Passung belegt, in einem isolierten Arbeitsbereich verwenden.
Audit
Prüfung nötigMaschinenlesbare Prüfung von Installationsbereitschaft, Sicherheitsmetadaten, Wartung und Akzeptanzrisiko.
OpenAgentSkill Trust Score v5
Menschliche Prüfung vor Installation
Nur in einer Sandbox ausführen und nahe Alternativen vergleichen, bevor sie produktiv eingesetzt wird.
Stars
895 GitHub-Stars
Repository-Aktivität
895 Stars und 298 Forks
Wartung
3 Monate seit dem letzten Push
Lizenz
MIT
Installieren
npx skills add pysam-developers/pysam
Installationssicherheit
Standard-Paket- oder Laufzeit-Installationspfad
Berechtigungsfläche
filesystem or document access, network or browser access
Agent-Ergebnisse
Noch keine Agent-Ergebnisdaten
Dokumentation
Starker README/SKILL.md-Kontext
Risikoübersicht
Vor Produktion prüfen
- Financial research output is not financial advice; require human review before any live investment decision.
- Quality score needs review
Installationsbereitschaft
Installationspfad verfügbar
- Installationspfad ist verfügbar
- Repository-Belege sind verfügbar
- Lizenz ist angegeben
- Noch keine Agent-Proven-Ergebnisbelege
Agent-lesbare Metadaten
Maschinenlesbare Entscheidungsdaten für diesen Skill.
Nutze diesen Block oder das eingebettete JSON, um zu entscheiden, ob ein Agent diesen Skill installieren, eine Alternative wählen oder zuerst menschliche Prüfung anfordern soll.
Geeignete Aufgaben
- Workflow-Automatisierung-Workflows
- Claude-Code-Teams
- Teams, die GitHub-Adoptionssignale schätzen
- Move data between tools
Geeignete Agents
Installationsentscheidung
- Befehl
- npx skills add pysam-developers/pysam
- Richtlinie
- Prüfen
- Menschliche Prüfung
- Ja
Vertrauen und Risiko
- Vertrauen
- 73/100
- Audit
- 84/100
- Risikoebene
- Prüfung nötig
Ergebnis-Loop
- Endpoint
- /api/agent/outcome
- Event-ID
- resolve
- Ergebnisse
- 5
Installationsbefehl
npx skills add pysam-developers/pysamNicht verwenden, wenn
- Teams, die ein vom Anbieter unterstütztes SLA benötigen
- Hochregulierte Umgebungen ohne interne Sicherheitsprüfung
- No major risk signals from current metadata
- Financial research output is not financial advice; require human review before any live investment decision
- Financial research output is not financial advice; require human review before any live investment decision.
Agent-Sicherheit v2
68/100 · Vor Installation prüfen
Nutzbarer Kandidat, aber der Agent sollte Berechtigungs- und Auditnotizen vor der Installation anzeigen.
Vor der Installation in einem echten Arbeitsbereich ist menschliche Freigabe erforderlich.
Mittel
Netzwerkzugriff
Die Skill ruft wahrscheinlich Remote-Seiten, APIs, Repositories oder externe Dienste ab.
Mittel
Dateisystemzugriff
Die Skill kann Projektdateien, Dokumente, generierte Artefakte oder den lokalen Arbeitsbereich lesen oder schreiben.
- Financial research output is not financial advice; require human review before any live investment decision
Installationsziele
Diesen Skill im Agent-Workflow installieren
Über den öffentlichen Endpunkt erhältst du Befehl, Sicherheitscheckliste, Ziel-Prompts und kanonische Links.
OpenAgentSkill CLI
Resolve policy, run the source installer safely, and report a verified install receipt.
$ npx --yes https://github.com/Leon-Drq/openagentskill/releases/download/cli-v0.2.1/openagentskill-0.2.1.tgz install pysam-developers-pysamAgent-Auflösungsplan
Lass einen Agent die Eignung vor der Installation prüfen.
Die Resolve API liefert die beste Skill, Alternativen, Sicherheitsrichtlinien, Auditnotizen, Installationsziel und einen direkt nutzbaren Prompt.
JSON öffnen
/api/agent/resolve?task=Use%20Pysam%20for%20an%20agent%20workflow&agent=codex&max_risk=medium
Resolve-Text
/api/agent/resolve?task=Use%20Pysam%20for%20an%20agent%20workflow&agent=codex&max_risk=medium&format=text
Installationsübergabe
/api/skills/pysam-developers-pysam/install
Agent sollte prüfen
- Task fit and alternatives from Resolve API.
- Audit score, trust score, and safety policy warnings.
- Install target compatibility for Codex, Claude Code, Cursor, or CLI.
Prompt kopieren
Task: Use Pysam in this workspace.
Resolve first: https://www.openagentskill.com/api/agent/resolve?task=Use%20Pysam%20for%20an%20agent%20workflow&agent=codex&max_risk=medium
Review install handoff: https://www.openagentskill.com/api/skills/pysam-developers-pysam/install
Install command: npx skills add pysam-developers/pysam
Before running it, summarize audit warnings, required permissions, and the fallback skill if install is risky.Agent-Übergabe
Gib dem Agent den Installationspfad, nicht noch ein Verzeichnis.
Über den öffentlichen Endpunkt erhältst du Befehl, Sicherheitscheckliste, Ziel-Prompts und kanonische Links.
Installationsübergabe
/api/skills/pysam-developers-pysam/install
LLM-Textformat
/api/skills/pysam-developers-pysam/install?format=text
Alternativen finden
/api/skills/search?q=Pysam&limit=3
Agent-Prompt
Use Pysam for this task. Review https://www.openagentskill.com/api/skills/pysam-developers-pysam/install, then install with: npx skills add pysam-developers/pysamRegistry-Metadaten
Agent-lesbares Profil für die automatische Skill-Auswahl.
Die Registry API stellt Entscheidungs-, Vertrauens-, Audit-, Use-Case- und Installationssignale ohne UI-Scraping bereit.
Manifest
/api/registry/manifest/pysam-developers-pysam
LLM-Text
/api/registry/manifest/pysam-developers-pysam?format=text
Installationsalias
/api/registry/install/pysam-developers-pysam
Empfehlen
/api/registry/recommend?task=Use%20Pysam%20in%20an%20agent%20workflow&limit=3
Agent-Fit
Workflow-Automatisierung
Plattformen
Cython, Bioinformatics, Claude Code
Audit-Bericht
Prüfung nötig · 84/100
Maschinenlesbare Prüfung von Installationsbereitschaft, Sicherheitsmetadaten, Wartung und Akzeptanzrisiko.
Agent-Entscheidungspanel
Primäre Wahl für Workflow-Automatisierung
Use this as a leading candidate, then validate the README and install path in your own agent stack.
Rolle im Stack
Primäre Wahl
Primäre Eignung
Workflow-Automatisierung
Vertrauenslabel
Produktionsbereit
Installationspfad
Befehl bereit
Verwenden wenn
- Workflow-Automatisierung-Workflows
- Claude-Code-Teams
- Teams, die GitHub-Adoptionssignale schätzen
Evidenz
- 895 GitHub-Stars
- recent repository activity
- install command or GitHub repo available
- Qualitätsprofil 81/100
- 8 OpenAgentSkill-Interaktionen
zuerst prüfen
- No major risk signals from current metadata
Implementierungspfad
- 1Installieren Sie es in einem Sandbox-Agent und führen Sie eine Workflow-Automatisierung-Aufgabe vollständig aus.
- 2Compare output quality, latency, and failure behavior against at least one alternative.
- 3Promote it into production only after reviewing repository permissions, license, and maintenance signals.
Vertrauensprofil
Nur Sandbox
Nützlicher Kandidat mit fehlenden oder gemischten Vertrauenssignalen. Bis der Ergebniszyklus die Passung belegt, in einem isolierten Arbeitsbereich verwenden.
GitHub-Akzeptanz
Info895 GitHub-Stars
Star-/Fork-Aktivität
Info895 Stars und 298 Forks; Issue-Aktivität ist in den aktuellen Metadaten nicht verfügbar
Aktuelle Wartung
Bestanden3 Monate seit dem letzten Push
Lizenzklarheit
BestandenMIT
Positive Signale
- KI-Prüfung genehmigt
- Installationspfad ist verfügbar
- Repository-Belege sind verfügbar
- Kürzlich gewartetes Repository
- Aussagekräftiges GitHub-Adoptionssignal
- Der Installationsbefehl weist kein offensichtliches Hochrisikomuster auf
- Ergebniszyklus ist bereit, benötigt aber den ersten echten Agent-Lauf
Vor Installation prüfen
- Financial research output is not financial advice; require human review before any live investment decision.
- Quality score needs review
- Noch keine echten Agent-Ergebnisberichte
- Vor unbeaufsichtigter Installation ist menschliche Prüfung erforderlich
Empfohlene Aktion
Nur in einer Sandbox ausführen und nahe Alternativen vergleichen, bevor sie produktiv eingesetzt wird.
Qualitätsprofil
Stark Kandidat für Agent-Workflows
Solid option that is likely worth shortlisting for production workflows.
Workflow-Eignung
Diese Skill in diesen Szenarien nutzen
Automate repeated work
Workflow automation
I need my agent to automate a repeated workflow across tools and files.
Manage repositories
GitHub automation
I need my agent to triage GitHub issues, review pull requests, and summarize repository changes.
Operate local tools
Local desktop
I need my agent to operate local files and desktop apps in a repeatable workflow.
Workflow-Eignung
Zum vollständigen Workflow hinzufügen
Turn skills into distribution
Content growth agent
A workflow for turning newly indexed skills into SEO briefs, social drafts, comparison pages, and reusable publishing workflows.
Inspect, patch, and verify code
Coding review agent
A workflow for software agents that inspect repositories, review pull requests, generate tests, and turn findings into shippable patches.
Ingest, retrieve, and cite
RAG knowledge base
A workflow for document-heavy agents that ingest files, create searchable knowledge, retrieve relevant context, and answer with grounded sources.
Alternativen-Shortlist
Vor Installation vergleichen
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Übersicht
Pysam is a Python package for reading, manipulating, and writing genomics data such as SAM/BAM/CRAM and VCF/BCF files. It's a lightweight wrapper of the HTSlib API, the same one that powers samtools, bcftools, and tabix.
Imported by the skill-only GitHub discovery pipeline because it matches agent skill, automation, domain workflow, RAG, document-processing, data, finance, security, or developer-tool signals. Protocol-server projects are excluded from automated imports.
Plattformkompatibilität
Technische Details
- Version
- 1.0.0
- Lizenz
- MIT
- Letzte Aktualisierung
- 18. Aug. 2026
- Veröffentlicht
- 16. Juni 2026
Frameworks & Tools
Entscheidungsübersicht
Primäre Wahl
895 GitHub-Stars
Audit
Installationsprüfung
Installations- und Adoptionsprüfung
- Sicherheit
- 86/100
- Wartung
- 88/100
- Installieren
- 92/100
Von Agent belegte Evidenz
Von Agent belegte Evidenz
Ergebnisberichte nach Resolve, Prüfung, Installation und einem begrenzten Lauf.
- Erfolgsrate
- —
- Letzter Fehler
- —
- Ergebnisse
- 0
- Ausgabequalität
- —
- Fehlgeschlagen
- 0
- Nicht relevant
- 0
- Installationen
- 0
- Durch Risiko blockiert
- 0
- Einrichtung erforderlich
- 0
- Produktion
- 0
Noch keine Agent-Ergebnisdaten. Der erste Lauf kann Erfolg, Einrichtungsbedarf, Risikoblockaden, Fehler oder Irrelevanz über /api/agent/outcome melden.
Installieren
Zum Agent-Workflow hinzufügen
Kostenlos und Open Source. Bericht vor der Installation in Produktions-Agents prüfen.
Wachstums-Loop
Share-Kit
Szenariobasierter Entwurf für Pysam, bereit für einen manuellen X-Post.
A practical pick for source-backed research: Pysam: Pysam is a Python package for reading, manipulating, and writing genomics data such as SAM/BAM/CRAM and VCF/BCF files. It's... 895 stars https://www.openagentskill.com/skills/pysam-developers-pysam?ref=x
Optionale Antwort mit Installationsbefehl
Listing + install path for Pysam: https://www.openagentskill.com/skills/pysam-developers-pysam?ref=x Install: npx skills add pysam-developers/pysam
Quelle des Eintrags
Community-indexiert
Dieser Eintrag wurde aus öffentlichen Quellen indexiert und ist erst nach Genehmigung eines Maintainer-Anspruchs offiziell.
- Ersteller
- pysam-developers
- Quelle
- pysam-developers/pysam
- Indexiert von
- OpenAgentSkill Community-Index
Die Zuordnung verlinkt auf das öffentliche Repository oder Creator-Profil. Creator können den Eintrag beanspruchen, um Eigentümersignale zu aktualisieren.
Diesen Skill beanspruchenEigentümeranspruch
Diesen Skill-Eintrag beanspruchen
Dieser Community-indexiert-Eintrag wird pysam-developers zugeschrieben, ist aber noch nicht offiziell markiert. Beanspruche ihn, um ein verifiziertes Eigentümersignal hinzuzufügen und künftige Launch-, Installations- und Audit-Updates vertrauenswürdiger zu machen.
Creator-Backlink-Kit
Evidenz-Badges in deine README einfügen
Zeige den kanonischen Eintrag, aktuelle Vertrauens- und Audit-Signale sowie echte Agent-Proven-Evidenz dort, wo Entwickler das Repository bewerten.
[](https://www.openagentskill.com/skills/pysam-developers-pysam)
[](https://www.openagentskill.com/skills/pysam-developers-pysam)
[](https://www.openagentskill.com/skills/pysam-developers-pysam/audit)
[](https://www.openagentskill.com/skills/pysam-developers-pysam)Autor
pysam-developers
@pysam-developers
Plattform-Fit
Gesundheitssignale
- GitHub-Stars
- 895
- Qualitätswert
- 51/100
- Letzter GitHub-Push
- 3. Juni 2026
- Framework-Hinweise
- 2
- OpenAgentSkill-Aufrufe
- 8
- Installationskopien
- 0
- Externe Klicks
- 0
Community-Signal
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Vertrauen & Sicherheit
Nur Sandbox
- GitHub-Akzeptanz895 GitHub-StarsInfo
- Star-/Fork-Aktivität895 Stars und 298 Forks; Issue-Aktivität ist in den aktuellen Metadaten nicht verfügbarInfo
- Aktuelle Wartung3 Monate seit dem letzten PushBestanden
- LizenzklarheitMITBestanden
- README/SKILL.md-VollständigkeitMetadaten enthalten ausreichend Nutzungs- und Workflow-KontextBestanden
- Abhängigkeits-/Laufzeitrisikonetwork or browser surfaceBestanden
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