Informe de auditoría del skill
bioservices Informe de auditoría.
Unified Python interface to 40+ bioinformatics services. Use when querying multiple databases (UniProt, KEGG, ChEMBL, Reactome) in a single workflow with consistent API. Best for cross-database analysis, ID mapping across services. For quick single-database lookups use gget; for sequence/file manipulation use biopython.
Trust Score de OpenAgentSkill
Trust Score de OpenAgentSkill
The Trust Score helps an agent decide whether a skill is safe enough to shortlist before installation.
Adopción en GitHub
Aprobado100
38K estrellas de GitHub
Actividad de stars/forks
Aprobado97
38K estrellas y 3.6K forks; la actividad de issues no está disponible en los metadatos actuales
Mantenimiento reciente
Aprobado88
1 meses desde el último push
Claridad de licencia
Aprobado86
GPLv3 license
Completitud de README/SKILL.md
Aprobado86
Los metadatos incluyen suficiente contexto de uso y flujo de trabajo
Riesgo de dependencias/runtime
Fallido28
command execution surface, credential or environment access
Disponibilidad de instalación
Aprobado92
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills --skill bioservices
Seguridad del comando de instalación
Aprobado92
Ruta estándar de paquete o instalación en tiempo de ejecución
Superficie de permisos
Fallido18
secrets or environment access, shell or command execution
Evidencia del repositorio
Aprobado86
https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/tree/main/skills/bioservices
Estado de revisión
Info66
Hay datos de revisión por IA disponibles
Resultados comprobados por Agent
Info54
Aún no hay datos de resultados del Agent
Comprobaciones
Revisión de instalación y adopción
Ruta de instalación
92
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills --skill bioservices
Repositorio
88
https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills/tree/main/skills/bioservices
Licencia
86
GPLv3 license
Mantenimiento
88
1 meses desde el último push
Revisión por IA
55
SKILL.md does not explicitly include a setup or installation step for the bioservices package; it assumes the dependency is already available.
Completitud de README/SKILL.md
86
Usable description available
Riesgo de dependencias
28
command execution surface, credential or environment access
Seguridad del comando de instalación
92
Ruta estándar de paquete o instalación en tiempo de ejecución
Superficie de permisos
18
secrets or environment access, shell or command execution
Actividad de stars/forks
97
38K estrellas y 3.6K forks; la actividad de issues no está disponible en los metadatos actuales
Adopción
88
38K estrellas de GitHub
Advertencias
- Dependency or permission surface needs review
- Permission surface may require sandboxing
- SKILL.md does not explicitly include a setup or installation step for the bioservices package; it assumes the dependency is already available.
- The documentation correctly warns about removed UniChem helper methods in bioservices 1.16.0, but the included scripts should be audited to ensure they do not still call deprecated methods like get_compound_id_from_kegg.
- No explicit input validation or data-handling guidance is given for untrusted compound names, identifiers, or web API responses, which is relevant for a network-connected bioinformatics skill.
- Permission surface needs review: secrets or environment access, shell or command execution
- Dependency/runtime risk: command execution surface, credential or environment access
- Permission surface: secrets or environment access, shell or command execution
Método
This report combines public metadata, AI review output, repository freshness, install readiness, OpenAgentSkill events, quality scoring, trust checks, and the agent safety gate. It is not a full source-code security review.
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