스킬 감사 보고서
alterlab-biopython 감사 보고서.
Manipulate biological sequences, parse FASTA/GenBank/PDB files, run phylogenetics, and access NCBI/PubMed programmatically via Biopython (Bio.SeqIO, Bio.Entrez, Bio.PDB, Bio.Blast). Use when scripting custom bioinformatics pipelines, batch-processing sequence files, automating BLAST, or fetching records from Entrez — for quick one-off database lookups use gget, for unified multi-service integration use bioservices. Part of the AlterLab Academic Skills suite.
OpenAgentSkill 신뢰 점수
OpenAgentSkill 신뢰 점수
Trust Score는 설치 전에 후보 목록에 넣을 만큼 안전한지 Agent가 판단하도록 돕습니다.
GitHub 채택도
경고48
GitHub 스타 66
스타/포크 활동
경고48
스타 66, 포크 13; 현재 메타데이터에서 이슈 활동을 확인할 수 없습니다
최근 유지보수
통과88
마지막 푸시 후 1개월
라이선스 명확성
통과86
MIT
README/SKILL.md 완성도
통과86
메타데이터에 충분한 사용 및 워크플로 맥락이 포함되어 있습니다
의존성/런타임 위험
실패38
command execution surface, credential or environment access
설치 가능 여부
통과92
npx skills add AlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills --skill alterlab-biopython
설치 명령 안전성
통과92
표준 패키지 또는 런타임 설치 경로
권한 범위
실패18
secrets or environment access, shell or command execution
저장소 근거
통과86
https://github.com/AlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills/tree/main/skills/bioinformatics/alterlab-biopython
검토 상태
정보66
AI 검토 데이터를 사용할 수 있습니다
Agent 검증 결과
정보54
아직 Agent 결과 데이터가 없습니다
검사
설치 및 채택 검토
설치 경로
92
npx skills add AlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills --skill alterlab-biopython
저장소
88
https://github.com/AlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills/tree/main/skills/bioinformatics/alterlab-biopython
라이선스
86
MIT
유지보수
88
마지막 푸시 후 1개월
AI 검토
55
The SKILL.md references Biopython 1.87 as the current version, which may become outdated; consider noting that version numbers change and recommend checking the official docs.
README/SKILL.md 완성도
86
Usable description available
의존성 위험
38
command execution surface, credential or environment access
설치 명령 안전성
92
표준 패키지 또는 런타임 설치 경로
권한 범위
18
secrets or environment access, shell or command execution
스타/포크 활동
48
스타 66, 포크 13; 현재 메타데이터에서 이슈 활동을 확인할 수 없습니다
채택도
68
GitHub 스타 66
경고
- Dependency or permission surface needs review
- Permission surface may require sandboxing
- The SKILL.md references Biopython 1.87 as the current version, which may become outdated; consider noting that version numbers change and recommend checking the official docs.
- The skill's allowed-tools include broad Bash(python:*) and Bash(uv:*), which is typical for coding skills but could be misused if the agent is compromised; however, this is a configuration concern, not a flaw in the skill itself.
- Quality score needs review
- Permission surface needs review: secrets or environment access, shell or command execution
- GitHub adoption: 66 GitHub stars
- Stars/forks activity: 66 stars, 13 forks; issue activity unavailable in current metadata
- Dependency/runtime risk: command execution surface, credential or environment access
- Permission surface: secrets or environment access, shell or command execution
방법
이 보고서는 공개 메타데이터, AI 검토 결과, 저장소 최신성, 설치 준비 상태, OpenAgentSkill 이벤트, 품질 점수, 신뢰 검사와 Agent 안전 게이트를 결합합니다. 전체 소스 코드 보안 감사는 아닙니다.
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