Rapport d’audit du skill
alterlab-arboreto Rapport d’audit.
Infer gene regulatory networks (GRNs) from expression matrices using arboreto's scalable GRNBoost2 and GENIE3 tree-ensemble algorithms with Dask-distributed computation. Use when analyzing bulk or single-cell RNA-seq transcriptomics to map transcription-factor-to-target-gene regulatory interactions, build adjacency networks, or run the GRN-inference step of a SCENIC pipeline on large datasets. Part of the AlterLab Academic Skills suite.
Trust Score OpenAgentSkill
Trust Score OpenAgentSkill
The Trust Score helps an agent decide whether a skill is safe enough to shortlist before installation.
Adoption GitHub
Avertissement48
66 stars GitHub
Activité stars/forks
Avertissement48
66 stars et 13 forks; l’activité des issues n’est pas disponible dans les métadonnées actuelles
Maintenance récente
Validé88
1 mois depuis le dernier push
Clarté de licence
Validé86
MIT
Complétude README/SKILL.md
Validé86
Les métadonnées incluent suffisamment de contexte d’usage et de workflow
Risque dépendances/runtime
Avertissement54
command execution surface, external package install surface
Disponibilité de l’installation
Validé92
npx skills add AlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills --skill alterlab-arboreto
Sécurité de la commande d’installation
Validé92
Chemin d’installation standard de package ou runtime
Surface de permissions
Avertissement48
shell or command execution, filesystem or document access
Preuve du dépôt
Validé86
https://github.com/AlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills/tree/main/skills/bioinformatics/alterlab-arboreto
État de revue
Validé88
Données de revue IA disponibles
Résultats prouvés par Agent
Info54
Pas encore de données de résultats Agent
Vérifications
Revue d’installation et d’adoption
Chemin d’installation
92
npx skills add AlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills --skill alterlab-arboreto
Dépôt
88
https://github.com/AlterLab-IEU/AlterLab-Academic-Skills/tree/main/skills/bioinformatics/alterlab-arboreto
Licence
86
MIT
Maintenance
88
1 mois depuis le dernier push
Revue IA
88
Approved with no listed issues
Complétude README/SKILL.md
86
Usable description available
Risque de dépendances
54
command execution surface, external package install surface
Sécurité de la commande d’installation
92
Chemin d’installation standard de package ou runtime
Surface de permissions
48
shell or command execution, filesystem or document access
Activité stars/forks
48
66 stars et 13 forks; l’activité des issues n’est pas disponible dans les métadonnées actuelles
Adoption
68
66 stars GitHub
Avertissements
- Dependency or permission surface needs review
- Permission surface may require sandboxing
- Quality score needs review
- Permission surface needs review: shell or command execution, filesystem or document access
- GitHub adoption: 66 GitHub stars
- Stars/forks activity: 66 stars, 13 forks; issue activity unavailable in current metadata
- Dependency/runtime risk: command execution surface, external package install surface
- Permission surface: shell or command execution, filesystem or document access
Méthode
This report combines public metadata, AI review output, repository freshness, install readiness, OpenAgentSkill events, quality scoring, trust checks, and the agent safety gate. It is not a full source-code security review.
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